La semana pasada se celebró la Conferencia Internacional “Digital Age & Technological Advances for sustainable development” IC-DATA 2022. Un evento organizado por La Facultad de Ciencias y Técnicas de Al-Hoceima de Marruecos. DATA es una conferencia exhaustiva centrada en los diversos aspectos de los avances de las tecnologías de la información para el desarrollo sostenible.

El objetivo principal de DATA es mejorar la investigación alcanzando la máxima capacidad y fomentando debates abiertos sobre la digitalización y las tecnologías recientes para el desarrollo sostenible.

Juan Manuel Corchado en DATA 2022

Juan Manuel Corchado durante la presentación de la Conferencia DATA 2022

 

En este sentido, Juan Manuel Corchado director del Grupo de Investigación BISITE y presidente del AIR Institute participó en la tercera edición de DATA para presentar un interesante proyecto sobre secuenciación de próxima generación que estamos desarrollando. DeepNGS, una herramienta que automatiza el flujo de trabajo de los análisis genéticos y puede ayudar en los procedimientos de diagnóstico.

Secuenciación de nueva generación: de la teoría a la práctica

También conocidas como secuenciación masiva paralela o profunda, las técnicas de Next Generation Sequencing (NGS) han revolucionado la investigación genómica actual. El uso de las últimas tecnologías en NGS (cloud computing, inteligencia artificial, aprendizaje automático) permite secuenciar genomas humanos completos en un solo día. Las anteriores tecnologías convencionales de Sanger tardaban más de una década en completar este proceso.

Sin embargo, la NGS aún no se ha convertido en una práctica clínica cotidiana. Las aplicaciones para el usuario final deben satisfacer las necesidades reales de cada médico, cada técnico de laboratorio, cada laboratorio de análisis de ADN, cada investigador.

Secuenciación

Juan Manuel Corchado durante la presentación de la Conferencia DATA 2022

DeepNGS es una plataforma rápida y automatizada para médicos e investigadores. Procesa muestras de ADN humano secuenciado y obtiene un conjunto de variantes genéticas clave para el diagnóstico clínico de cualquier paciente.

Nuestra plataforma incorpora todos los datos genéticos del paciente en un entorno de alta seguridad en la nube y consigue un mayor nivel de precisión. Es capaz de digerir la información para asegurar la precisión del diagnóstico final y la adecuación de las recomendaciones de tratamiento. Estamos incorporando progresivamente algoritmos ML para optimizar el proceso de análisis y lograr resultados aún mejores y más fiables.

Una vez completadas las etapas de alineación, detección de variantes y anotación, la intuitiva interfaz de DeepNGS ofrece una visión general y una gran cantidad de visualizaciones de las que se pueden extraer conclusiones inmediatamente.

Ha sido una excelente oportunidad para dar a conocer el trabajo que estamos desarrollando tanto en BISITE como en AIR Institute para el impulso de la investigación científica.

Escrito por Juan M. Corchado

Juan Manuel Corchado (15 May 1971, Salamanca, Spain) is Professor at the University of Salamanca. He has been Vice-Rector for Research from 2013 to 2017 and Director of the Science Park of the University of Salamanca. Elected as Dean of the Faculty of Science twice, he holds a PhD in Computer Science from the University of Salamanca and a PhD in Artificial Intelligence from the University of the West of Scotland. He leads the renowned BISITE (Bioinformatics, Intelligent Systems and Educational Technology) Research Group, created in 2000. Director of the IoT Digital Innovation Hub and President of the AIR Institute, J. M. Corchado is also Visiting Professor at the Osaka Institute of Technology since January 2015, Visiting Professor at the Universiti Malaysia Kelantan and Member of the Advisory Group on Online Terrorist Propaganda of the European Counter Terrorism Centre (EUROPOL). J. M. Corchado has been president of the IEEE Systems, Man and Cybernetics Society, and academic coordinator of the University Institute for Research in Art and Animation Technology at the University of Salamanca, as well as researcher at the Universities of Paisley (UK), Vigo (Spain) and the Plymouth Marine Laboratory (UK). He currently combines all his activity with the direction of Master programmes in Security, Digital Animation, Mobile Telephony, Information Systems Management, Internet of Things, Social Media, 3D Design and Printing, Blockchain, Z System, Industry 4.0, Agile Project Management, and Smart Cities & Intelligent Buildings, at the University of Salamanca and his work as editor-in-chief of the journals ADCAIJ (Advances in Distributed Computing and Artificial Intelligence Journal), OJCST (Oriental Journal of Computer Science and Technology) or Electronics MDPI (Computer Science & Engineering section). J. M. Corchado mainly works on projects related to Artificial Intelligence, Machine Learning, Blockchain, IoT, Fog Computing, Edge Computing, Smart Cities, Smart Grids and Sentiment Analysis. He has recently been included in the board of trustees of the AstraZeneca Foundation, along with other health professionals and researchers recognised for bringing scientific knowledge closer to society.